一般就商业化试剂盒而言,在上市前应完成一定的耐用性研究,比如在不同检验设备上的适用性,不同实验室间,不同精度条件下的性能表现研究。在特定实验室展开的工作可以不做额外耐用性研究。但是如果涉及室间平行性验证以及残留检测报告,就需要进行耐用性研究。
因为PCR技术的高灵敏度,主要污染可能来自操作环境中的气溶胶,或者校准品配制产生的气溶胶。因此建议定量PCR检测实验室参考PCR标准实验室进行设计和执行规范操作,使用带滤芯的移液枪头,规范移液操作,以及实验阳性垃圾处理规范等。在不具备标准PCR实验室条件下,尽可能采取阴阳性分区操作模式,先阴后阳的一般规则,避免阳性物质污染到样本。此外,每次的检验,应完整设计对照,用于污染水平控制,包括NTC,NEG/NCS。
阴性对照的Ct值来自NTC以及NEG/NCS,分别代表扩增试剂本身的背景,以及含有样本后产生的反应背景。不同检测系统会产生不同的Ct值,而且不同设备或不同实验室的阴性对照Ct值也会有差异,其合格的决定因素在于背景是否与LLOD或者LLOQ能显著区分开。 关于IC,做为内部质控对照,起到了监测特定反应是否存在干扰的作用。原理上因为干扰物对不同扩增反应影响程度不同,常见干扰物对于IC对照干扰作用更显著,因此会出现干扰物的存在对样本检测通道的Ct影响看起来不大,但是对IC通道Ct值产生明显影响,有利判断样本检测结果是因为大误差还是干扰;
不确定度的计算,除了需要根据移液器的精密度来计算,还需要确定传递方式。因此考查不确定度时,需要以移液设备以及制备工艺为基础;
方法学验证一般需要进行2-3批的验证,重复性和准确度的评价是方法学验证中必须验证的项目,也需要完成2-3批的验证。定性方法学与定量方法学在具体验证中要求有所不同,可以参考药典及行业标准的要求。
药典规定回收率是50%-150%,一般行业标准是70%-130%。
关于定量下限检测Ct值的问题,因为我们是用的非16s单拷贝基因,所以本身在30fg/ul,也就是差不多60个拷贝,Ct值有可能是超出35的。另外最后一点的检测重复性不好也是因为拷贝数低,在溶液体系中存在泊松分布,有可能在造成稀释的不准确或者是加样吸取的误差。
均适用,但要考虑样本的干扰问题,进行适用性研究。
SPA回收率低,和抗体以及基质pH,盐离子,或表面活性剂/变性剂有关。
不需要,我们采用的是热变性前处理方法。